טיפול שורש הוא טיפול שגרתי שנעשה בשן שהעששת שבה חדרה לזגוגית ולשכבת הדנטין של השן והגיעה ץ.למוך השן , או כאשר עקב חבלה נחשף מוך השן לזיהום
המוך השןהוא הרקמה הפנימית של השן שיש בה כלי דם ועצבים, או כאשר עקב חבלה נחשף מוך השן לזיהום.
טיפול שורש נעשה בדרך כלל בהרדמה מקומית, אך לעתים ניתן לבצעו ללא אלחוש מקומי, כאשר השן איבדה את החיות שלה. לפני טיפול השורש חובה לעשות צילום רנטגן כדי לוודא מה מצבה של השן, ולאבחן את המחלה בשן (דלקת מוך השן, מורסה סב חודית וכדומה). במהלך הטיפול מקובל לערוך צילומים נוספים, כדי לוודא את אורך תעלות השורש. לאחר ניקוי תעלות השורש דוחסים לתעלות חומר סתימה מיוחד (גוטה פרקה, למשל) שתפקידו למנוע חדירת חיידקים והתרבותם באזור זה, דבר שעלול לגרום לדלקת בעצם.
טיפול שורש עשוי להתבצע במספר פגישות. ישנם מקרים בהם אפשר לבצעאת טיפול השורש במפגש ​אחד.